Der bekannte Magento Rundungsfehler ist auch in der neuesten Version 1.6 noch vorhanden.

Schnelle Abhilfe schafft aber auch hier ein Core-Rewrite der Funktion roundPrice() in der Datei app/code/local/Mage/Core/Model/Store.php

public function roundPrice($price)
{
   return round($price, 4);
}